Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
CFTRP13569 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CFTRP13569 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CFTRP13569 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CFTRP13569 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CFTRP13569 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CFTRP13569 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CFTRP13569 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CFTRP13569 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CFTRP13569 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CFTRP13569 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CFTRP13569 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CFTRP13569 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
CFTRP13569 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
CFTRP13569 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CFTRP13569 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
CFTRP13569 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
CFTRP13569 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CFTRP13569 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CFTRP13569 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CFTRP13569 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CFTRP13569 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CFTRP13569 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CFTRP13569 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CFTRP13569 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
CFTRP13569 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CFTRP13569 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CFTRP13569 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CFTRP13569 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CFTRP13569 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CFTRP13569 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CFTRP13569 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CFTRP13569 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CFTRP13569 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CFTRP13569 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CFTRP13569 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CFTRP13569 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CFTRP13569 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CFTRP13569 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
CFTRP13569 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CFTRP13569 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CFTRP13569 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CFTRP13569 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CFTRP13569 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
CFTRP13569 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CFTRP13569 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CFTRP13569 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
CFTRP13569 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
CFTRP13569 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
CFTRP13569 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CFTRP13569 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
CFTRP13569 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
CFTRP13569 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CFTRP13569 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CFTRP13569 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CFTRP13569 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
CFTRP13569 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CFTRP13569 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CFTRP13569 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CFTRP13569 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CFTRP13569 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CFTRP13569 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CFTRP13569 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CFTRP13569 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CFTRP13569 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
CFTRP13569 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
CFTRP13569 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
CFTRP13569 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
CFTRP13569 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CFTRP13569 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CFTRP13569 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CFTRP13569 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CFTRP13569 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
CFTRP13569 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
CFTRP13569 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CFTRP13569 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CFTRP13569 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CFTRP13569 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CFTRP13569 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CFTRP13569 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CFTRP13569 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CFTRP13569 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CFTRP13569 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CFTRP13569 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CFTRP13569 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CFTRP13569 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CFTRP13569 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CFTRP13569 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CFTRP13569 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CFTRP13569 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CFTRP13569 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CFTRP13569 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CFTRP13569 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CFTRP13569 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CFTRP13569 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CFTRP13569 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CFTRP13569 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CFTRP13569 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CFTRP13569 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CFTRP13569 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms