Protein–RNA interactions for Protein: P13385

TDGF1, Teratocarcinoma-derived growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGF1P13385 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDGF1P13385 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms