Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
LAMC1P11047 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LAMC1P11047 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms