Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYBBP04839 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYBBP04839 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYBBP04839 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYBBP04839 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYBBP04839 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYBBP04839 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYBBP04839 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYBBP04839 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYBBP04839 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYBBP04839 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYBBP04839 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYBBP04839 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYBBP04839 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYBBP04839 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYBBP04839 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYBBP04839 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYBBP04839 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYBBP04839 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYBBP04839 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYBBP04839 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYBBP04839 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYBBP04839 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYBBP04839 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYBBP04839 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYBBP04839 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYBBP04839 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYBBP04839 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYBBP04839 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYBBP04839 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYBBP04839 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYBBP04839 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYBBP04839 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYBBP04839 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYBBP04839 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYBBP04839 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYBBP04839 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYBBP04839 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYBBP04839 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYBBP04839 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYBBP04839 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYBBP04839 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYBBP04839 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYBBP04839 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYBBP04839 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYBBP04839 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYBBP04839 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYBBP04839 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYBBP04839 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYBBP04839 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYBBP04839 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYBBP04839 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYBBP04839 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYBBP04839 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYBBP04839 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYBBP04839 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYBBP04839 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYBBP04839 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYBBP04839 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYBBP04839 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYBBP04839 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYBBP04839 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYBBP04839 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYBBP04839 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYBBP04839 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYBBP04839 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYBBP04839 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYBBP04839 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYBBP04839 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYBBP04839 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CYBBP04839 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CYBBP04839 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CYBBP04839 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYBBP04839 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYBBP04839 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYBBP04839 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYBBP04839 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYBBP04839 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYBBP04839 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYBBP04839 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYBBP04839 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYBBP04839 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYBBP04839 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYBBP04839 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYBBP04839 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYBBP04839 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYBBP04839 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYBBP04839 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYBBP04839 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYBBP04839 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYBBP04839 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYBBP04839 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYBBP04839 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYBBP04839 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYBBP04839 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYBBP04839 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYBBP04839 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYBBP04839 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYBBP04839 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYBBP04839 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms