Protein–RNA interactions for Protein: P00352

ALDH1A1, Retinal dehydrogenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A1P00352 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALDH1A1P00352 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1A1P00352 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ALDH1A1P00352 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALDH1A1P00352 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms