Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC25A20O43772 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms