Protein–RNA interactions for Protein: O15127

SCAMP2, Secretory carrier-associated membrane protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP2O15127 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP2O15127 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP2O15127 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms