Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NFKBIEO00221 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIEO00221 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms