Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERVV-1B6SEH8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERVV-1B6SEH8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERVV-1B6SEH8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERVV-1B6SEH8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ERVV-1B6SEH8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERVV-1B6SEH8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERVV-1B6SEH8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERVV-1B6SEH8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERVV-1B6SEH8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ERVV-1B6SEH8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERVV-1B6SEH8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms