Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DXG7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DXG7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DXG7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DXG7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DXG7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DXG7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DXG7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DXG7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DXG7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DXG7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DXG7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DXG7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DXG7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DXG7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DXG7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DXG7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DXG7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DXG7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DXG7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DXG7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DXG7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
B4DXG7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DXG7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DXG7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DXG7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DXG7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DXG7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DXG7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DXG7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DXG7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DXG7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DXG7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DXG7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DXG7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DXG7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DXG7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DXG7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DXG7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DXG7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DXG7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DXG7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DXG7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DXG7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DXG7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DXG7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DXG7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DXG7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DXG7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DXG7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DXG7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DXG7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DXG7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DXG7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DXG7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DXG7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DXG7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DXG7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DXG7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DXG7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DXG7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DXG7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DXG7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B4DXG7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
B4DXG7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
B4DXG7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
B4DXG7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
B4DXG7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
B4DXG7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
B4DXG7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
B4DXG7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B4DXG7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B4DXG7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B4DXG7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B4DXG7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
B4DXG7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
B4DXG7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
B4DXG7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B4DXG7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
B4DXG7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
B4DXG7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B4DXG7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
B4DXG7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B4DXG7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
B4DXG7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B4DXG7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
B4DXG7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
B4DXG7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
B4DXG7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B4DXG7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B4DXG7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B4DXG7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4DXG7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4DXG7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4DXG7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4DXG7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4DXG7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4DXG7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4DXG7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4DXG7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms