Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPED1A4D0V7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPED1A4D0V7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPED1A4D0V7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPED1A4D0V7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPED1A4D0V7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPED1A4D0V7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPED1A4D0V7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPED1A4D0V7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPED1A4D0V7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPED1A4D0V7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPED1A4D0V7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPED1A4D0V7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPED1A4D0V7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPED1A4D0V7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms