Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms