Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRDM9Q9NQV7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms