Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms