Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms