Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN17P56750 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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CLDN17P56750 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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CLDN17P56750 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN17P56750 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN17P56750 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN17P56750 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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