Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RORAP35398 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RORAP35398 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RORAP35398 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORAP35398 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORAP35398 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms