Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JAK1P23458 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JAK1P23458 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JAK1P23458 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JAK1P23458 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JAK1P23458 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JAK1P23458 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JAK1P23458 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JAK1P23458 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JAK1P23458 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JAK1P23458 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JAK1P23458 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JAK1P23458 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JAK1P23458 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JAK1P23458 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JAK1P23458 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JAK1P23458 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JAK1P23458 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JAK1P23458 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JAK1P23458 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JAK1P23458 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms