Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GCSHP23434 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GCSHP23434 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GCSHP23434 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GCSHP23434 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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GCSHP23434 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSHP23434 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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GCSHP23434 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
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GCSHP23434 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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GCSHP23434 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
GCSHP23434 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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GCSHP23434 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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GCSHP23434 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSHP23434 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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