Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 RBM3-203ENST00000376759 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.456e-9■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 RBM3-209ENST00000490127 567 ntTSL 510.73□□□□□ -0.696e-9■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 COMT-207ENST00000412786 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.44■□□□□ 0.069e-7■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 COMT-201ENST00000207636 1319 ntTSL 514.48□□□□□ -0.099e-7■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.099e-7■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 RBMS1-214ENST00000491781 1533 ntTSL 1 (best)16.05■□□□□ 0.161e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.722e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 LRP6-202ENST00000535731 562 ntTSL 318.51■□□□□ 0.552e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.191e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 RECQL5-206ENST00000578201 1972 ntTSL 515.16■□□□□ 0.021e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.181e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.351e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 RECQL5-201ENST00000317905 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.411e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 RECQL5-203ENST00000420326 3710 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.021e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 LIME1-204ENST00000476183 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.07■□□□□ 0.89e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.69e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 5314 ntTSL 218.62■□□□□ 0.571e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 NOTUM-204ENST00000489218 972 ntTSL 218.14■□□□□ 0.498e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TM7SF2-220ENST00000531029 530 ntTSL 517.67■□□□□ 0.424e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TM7SF2-213ENST00000529233 756 ntTSL 317.44■□□□□ 0.384e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.241e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TM7SF2-209ENST00000527851 976 ntTSL 316.29■□□□□ 0.24e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.111e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.238e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SPG7-215ENST00000566682 756 ntTSL 312.99□□□□□ -0.331e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 APOC3-204ENST00000470144 269 ntTSL 512.47□□□□□ -0.411e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 ANAPC7-201ENST00000450008 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.498e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 ANAPC7-204ENST00000464697 734 ntTSL 311.63□□□□□ -0.558e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.571e-11■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 ANAPC7-212ENST00000552170 579 ntTSL 410.63□□□□□ -0.718e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 APOC3-201ENST00000227667 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.731e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 APOC3-203ENST00000433777 359 ntTSL 59.3□□□□□ -0.921e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CEBPZOS-202ENST00000397064 568 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.961e-11■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CEBPZOS-201ENST00000392061 695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -11e-11■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.11e-11■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CEBPZOS-207ENST00000470216 800 ntTSL 55.66□□□□□ -1.51e-11■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.68e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.71e-11■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 HSP90AA1-210ENST00000560130 488 ntTSL 24.12□□□□□ -1.753e-7■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 ZNF692-209ENST00000474351 867 ntTSL 211.1□□□□□ -0.633e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.773e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.463e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 HGS-216ENST00000576498 1004 ntTSL 217.21■□□□□ 0.353e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 HGS-214ENST00000576087 548 ntTSL 415.01□□□□□ -0.013e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 HGS-208ENST00000572392 824 ntTSL 514.92□□□□□ -0.023e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.313e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SUPT5H-216ENST00000599335 3796 ntTSL 211.35□□□□□ -0.592e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TMBIM1-211ENST00000440422 659 ntTSL 521.82■■□□□ 1.084e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 BCL6-205ENST00000438077 709 ntTSL 319.78■□□□□ 0.762e-7■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.514e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TMBIM1-205ENST00000420341 361 ntTSL 414.69□□□□□ -0.064e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.214e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.284e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TMBIM1-213ENST00000444183 526 ntTSL 512.88□□□□□ -0.354e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TMBIM1-217ENST00000453281 534 ntTSL 212.88□□□□□ -0.354e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TMBIM1-208ENST00000434015 580 ntTSL 312.34□□□□□ -0.434e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TMBIM1-223ENST00000495113 596 ntTSL 212.33□□□□□ -0.444e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TMBIM1-220ENST00000466012 572 ntTSL 511.8□□□□□ -0.524e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TMBIM1-203ENST00000413976 348 ntTSL 411.06□□□□□ -0.644e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.724e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TMBIM1-209ENST00000437694 992 ntTSL 210.12□□□□□ -0.794e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.84e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TMBIM1-215ENST00000445635 1251 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.874e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.884e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.884e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.894e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.934e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.964e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.984e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.984e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.984e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.984e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.984e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.984e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.994e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.034e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.044e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.044e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.044e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.064e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.074e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.094e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.094e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.134e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.144e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.24e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.24e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.234e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.244e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.344e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.344e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 KDM6B-206ENST00000575521 219 ntTSL 513.58□□□□□ -0.242e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 HNRNPD-205ENST00000507010 748 ntTSL 323.67■■□□□ 1.383e-9■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.243e-9■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 HNRNPD-209ENST00000513584 1240 ntTSL 222.65■■□□□ 1.223e-9■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.183e-9■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 HNRNPD-204ENST00000503822 607 ntTSL 521.37■■□□□ 1.013e-9■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 HNRNPD-207ENST00000509107 583 ntTSL 519.98■□□□□ 0.793e-9■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.593e-9■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 HNRNPD-212ENST00000515432 545 ntTSL 56.65□□□□□ -1.343e-9■□□□□ 10.4
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