Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOPXQ9BPY8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms