Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RNF148Q8N7C7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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RNF148Q8N7C7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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RNF148Q8N7C7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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RNF148Q8N7C7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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