Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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