Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms