Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NKPD1Q17RQ9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NKPD1Q17RQ9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NKPD1Q17RQ9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NKPD1Q17RQ9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NKPD1Q17RQ9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NKPD1Q17RQ9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NKPD1Q17RQ9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NKPD1Q17RQ9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NKPD1Q17RQ9 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NKPD1Q17RQ9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NKPD1Q17RQ9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NKPD1Q17RQ9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NKPD1Q17RQ9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms