Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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