Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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