Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms