Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms