Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms