Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC17Q8N6Y2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms