Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms