Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms