Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms