Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AFMP43652 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFMP43652 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFMP43652 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFMP43652 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms