Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms