Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms