Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA4P06727 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA4P06727 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOA4P06727 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOA4P06727 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOA4P06727 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOA4P06727 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOA4P06727 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOA4P06727 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOA4P06727 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOA4P06727 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA4P06727 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA4P06727 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA4P06727 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA4P06727 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA4P06727 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms