Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF13O43567 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF13O43567 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF13O43567 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF13O43567 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF13O43567 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF13O43567 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF13O43567 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF13O43567 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF13O43567 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF13O43567 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF13O43567 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF13O43567 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF13O43567 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF13O43567 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms