Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms