Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB19A4D1S5 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB19A4D1S5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB19A4D1S5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB19A4D1S5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB19A4D1S5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB19A4D1S5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB19A4D1S5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB19A4D1S5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB19A4D1S5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB19A4D1S5 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB19A4D1S5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB19A4D1S5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB19A4D1S5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms