Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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