Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms