Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms