Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms