Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms