Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RRN3P1Q2M238 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms