Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms