Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms