Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms